Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CluhQ5SW19 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CluhQ5SW19 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CluhQ5SW19 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CluhQ5SW19 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CluhQ5SW19 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CluhQ5SW19 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CluhQ5SW19 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CluhQ5SW19 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CluhQ5SW19 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CluhQ5SW19 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CluhQ5SW19 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CluhQ5SW19 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CluhQ5SW19 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CluhQ5SW19 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CluhQ5SW19 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CluhQ5SW19 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CluhQ5SW19 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CluhQ5SW19 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CluhQ5SW19 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CluhQ5SW19 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CluhQ5SW19 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CluhQ5SW19 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CluhQ5SW19 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CluhQ5SW19 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CluhQ5SW19 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CluhQ5SW19 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CluhQ5SW19 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CluhQ5SW19 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CluhQ5SW19 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CluhQ5SW19 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CluhQ5SW19 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CluhQ5SW19 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CluhQ5SW19 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CluhQ5SW19 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CluhQ5SW19 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CluhQ5SW19 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CluhQ5SW19 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CluhQ5SW19 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CluhQ5SW19 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms