Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctc1Q5SUQ9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctc1Q5SUQ9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ctc1Q5SUQ9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctc1Q5SUQ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms