Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PkdccQ5RJI4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PkdccQ5RJI4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PkdccQ5RJI4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PkdccQ5RJI4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms