Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim58Q5NCC9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim58Q5NCC9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim58Q5NCC9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim58Q5NCC9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim58Q5NCC9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim58Q5NCC9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim58Q5NCC9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim58Q5NCC9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim58Q5NCC9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim58Q5NCC9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim58Q5NCC9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim58Q5NCC9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim58Q5NCC9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim58Q5NCC9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim58Q5NCC9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim58Q5NCC9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim58Q5NCC9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim58Q5NCC9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim58Q5NCC9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim58Q5NCC9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim58Q5NCC9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim58Q5NCC9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim58Q5NCC9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim58Q5NCC9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim58Q5NCC9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim58Q5NCC9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim58Q5NCC9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim58Q5NCC9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim58Q5NCC9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim58Q5NCC9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim58Q5NCC9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim58Q5NCC9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim58Q5NCC9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim58Q5NCC9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim58Q5NCC9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim58Q5NCC9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim58Q5NCC9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim58Q5NCC9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim58Q5NCC9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim58Q5NCC9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trim58Q5NCC9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trim58Q5NCC9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trim58Q5NCC9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim58Q5NCC9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim58Q5NCC9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim58Q5NCC9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim58Q5NCC9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms