Protein–RNA interactions for Protein: Q5M956

Kctd1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd1Q5M956 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Kctd1Q5M956 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kctd1Q5M956 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kctd1Q5M956 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kctd1Q5M956 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kctd1Q5M956 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kctd1Q5M956 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kctd1Q5M956 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kctd1Q5M956 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kctd1Q5M956 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kctd1Q5M956 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kctd1Q5M956 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kctd1Q5M956 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kctd1Q5M956 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kctd1Q5M956 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kctd1Q5M956 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kctd1Q5M956 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kctd1Q5M956 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kctd1Q5M956 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Kctd1Q5M956 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kctd1Q5M956 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kctd1Q5M956 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kctd1Q5M956 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kctd1Q5M956 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kctd1Q5M956 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kctd1Q5M956 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kctd1Q5M956 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kctd1Q5M956 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kctd1Q5M956 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kctd1Q5M956 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kctd1Q5M956 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms