Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps41Q5KU39 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps41Q5KU39 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps41Q5KU39 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps41Q5KU39 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps41Q5KU39 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps41Q5KU39 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps41Q5KU39 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps41Q5KU39 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps41Q5KU39 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps41Q5KU39 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms