Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH62

Xkr9, XK-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xkr9Q5GH62 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xkr9Q5GH62 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xkr9Q5GH62 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xkr9Q5GH62 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Xkr9Q5GH62 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xkr9Q5GH62 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Xkr9Q5GH62 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Xkr9Q5GH62 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xkr9Q5GH62 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xkr9Q5GH62 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xkr9Q5GH62 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xkr9Q5GH62 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xkr9Q5GH62 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xkr9Q5GH62 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xkr9Q5GH62 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xkr9Q5GH62 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Xkr9Q5GH62 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xkr9Q5GH62 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms