Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spsb3Q571F5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spsb3Q571F5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spsb3Q571F5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spsb3Q571F5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb3Q571F5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms