Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc110Q3V125 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc110Q3V125 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc110Q3V125 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc110Q3V125 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms