Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0V0

Ldlrad2, Low density lipoprotein receptor A domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad2Q3V0V0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ldlrad2Q3V0V0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ldlrad2Q3V0V0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ldlrad2Q3V0V0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ldlrad2Q3V0V0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ldlrad2Q3V0V0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldlrad2Q3V0V0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms