Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SvipQ3UZP4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SvipQ3UZP4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SvipQ3UZP4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvipQ3UZP4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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