Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYK3

Tbc1d9, TBC1 domain family member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9Q3UYK3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tbc1d9Q3UYK3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tbc1d9Q3UYK3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tbc1d9Q3UYK3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tbc1d9Q3UYK3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tbc1d9Q3UYK3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tbc1d9Q3UYK3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tbc1d9Q3UYK3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tbc1d9Q3UYK3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tbc1d9Q3UYK3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tbc1d9Q3UYK3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tbc1d9Q3UYK3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tbc1d9Q3UYK3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tbc1d9Q3UYK3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tbc1d9Q3UYK3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tbc1d9Q3UYK3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tbc1d9Q3UYK3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tbc1d9Q3UYK3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tbc1d9Q3UYK3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Tbc1d9Q3UYK3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tbc1d9Q3UYK3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tbc1d9Q3UYK3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tbc1d9Q3UYK3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Tbc1d9Q3UYK3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Tbc1d9Q3UYK3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tbc1d9Q3UYK3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tbc1d9Q3UYK3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tbc1d9Q3UYK3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tbc1d9Q3UYK3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tbc1d9Q3UYK3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tbc1d9Q3UYK3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tbc1d9Q3UYK3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tbc1d9Q3UYK3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tbc1d9Q3UYK3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tbc1d9Q3UYK3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tbc1d9Q3UYK3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tbc1d9Q3UYK3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tbc1d9Q3UYK3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tbc1d9Q3UYK3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tbc1d9Q3UYK3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tbc1d9Q3UYK3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tbc1d9Q3UYK3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tbc1d9Q3UYK3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tbc1d9Q3UYK3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tbc1d9Q3UYK3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tbc1d9Q3UYK3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tbc1d9Q3UYK3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tbc1d9Q3UYK3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Tbc1d9Q3UYK3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tbc1d9Q3UYK3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tbc1d9Q3UYK3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tbc1d9Q3UYK3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tbc1d9Q3UYK3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms