Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C87499Q3UX49 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
C87499Q3UX49 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
C87499Q3UX49 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C87499Q3UX49 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms