Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga4Q3UW12 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnga4Q3UW12 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnga4Q3UW12 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cnga4Q3UW12 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnga4Q3UW12 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms