Protein–RNA interactions for Protein: Q3UST5

UPF0764 protein C16orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UST5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UST5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q3UST5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UST5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UST5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q3UST5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3UST5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3UST5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UST5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UST5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UST5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UST5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UST5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UST5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UST5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UST5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UST5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UST5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3UST5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3UST5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q3UST5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q3UST5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q3UST5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q3UST5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UST5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UST5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UST5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UST5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UST5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UST5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UST5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UST5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UST5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UST5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UST5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3UST5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3UST5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3UST5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3UST5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3UST5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3UST5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3UST5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3UST5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3UST5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3UST5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3UST5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3UST5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3UST5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q3UST5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3UST5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3UST5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3UST5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3UST5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3UST5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3UST5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3UST5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3UST5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3UST5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3UST5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3UST5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UST5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UST5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UST5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UST5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3UST5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3UST5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3UST5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3UST5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3UST5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3UST5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3UST5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3UST5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3UST5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3UST5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3UST5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3UST5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3UST5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UST5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UST5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UST5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UST5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UST5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UST5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UST5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UST5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UST5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UST5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UST5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UST5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UST5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UST5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UST5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UST5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UST5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UST5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3UST5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3UST5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3UST5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3UST5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UST5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms