Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cracr2aQ3UP38 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cracr2aQ3UP38 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cracr2aQ3UP38 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cracr2aQ3UP38 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms