Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Washc4Q3UMB9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Washc4Q3UMB9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Washc4Q3UMB9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Washc4Q3UMB9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Washc4Q3UMB9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Washc4Q3UMB9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Washc4Q3UMB9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Washc4Q3UMB9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Washc4Q3UMB9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Washc4Q3UMB9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Washc4Q3UMB9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Washc4Q3UMB9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Washc4Q3UMB9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Washc4Q3UMB9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Washc4Q3UMB9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Washc4Q3UMB9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Washc4Q3UMB9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Washc4Q3UMB9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Washc4Q3UMB9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Washc4Q3UMB9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Washc4Q3UMB9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms