Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cog7Q3UM29 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cog7Q3UM29 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cog7Q3UM29 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cog7Q3UM29 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms