Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULL6

Upf3b, UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3bQ3ULL6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Upf3bQ3ULL6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Upf3bQ3ULL6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Upf3bQ3ULL6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms