Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E330014E10RikQ3UL33 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E330014E10RikQ3UL33 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E330014E10RikQ3UL33 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms