Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arfgef3Q3UGY8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arfgef3Q3UGY8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Arfgef3Q3UGY8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms