Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf166Q3U9F6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf166Q3U9F6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnf166Q3U9F6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rnf166Q3U9F6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rnf166Q3U9F6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf166Q3U9F6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnf166Q3U9F6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms