Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cops9Q3U898 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cops9Q3U898 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cops9Q3U898 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms