Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3S3

Cenpl, Centromere protein L, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenplQ3U3S3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenplQ3U3S3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenplQ3U3S3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenplQ3U3S3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms