Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J0

Slc38a5, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a5Q3U1J0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc38a5Q3U1J0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc38a5Q3U1J0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc38a5Q3U1J0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc38a5Q3U1J0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc38a5Q3U1J0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc38a5Q3U1J0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc38a5Q3U1J0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc38a5Q3U1J0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc38a5Q3U1J0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc38a5Q3U1J0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc38a5Q3U1J0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc38a5Q3U1J0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc38a5Q3U1J0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc38a5Q3U1J0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc38a5Q3U1J0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc38a5Q3U1J0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc38a5Q3U1J0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc38a5Q3U1J0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc38a5Q3U1J0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc38a5Q3U1J0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc38a5Q3U1J0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc38a5Q3U1J0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc38a5Q3U1J0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms