Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hace1Q3U0D9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hace1Q3U0D9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hace1Q3U0D9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hace1Q3U0D9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms