Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Psmd1Q3TXS7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Psmd1Q3TXS7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Psmd1Q3TXS7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Psmd1Q3TXS7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Psmd1Q3TXS7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Psmd1Q3TXS7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Psmd1Q3TXS7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Psmd1Q3TXS7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Psmd1Q3TXS7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Psmd1Q3TXS7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Psmd1Q3TXS7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Psmd1Q3TXS7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Psmd1Q3TXS7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Psmd1Q3TXS7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Psmd1Q3TXS7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Psmd1Q3TXS7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psmd1Q3TXS7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psmd1Q3TXS7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psmd1Q3TXS7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psmd1Q3TXS7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Psmd1Q3TXS7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psmd1Q3TXS7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Psmd1Q3TXS7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psmd1Q3TXS7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Psmd1Q3TXS7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Psmd1Q3TXS7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Psmd1Q3TXS7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Psmd1Q3TXS7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psmd1Q3TXS7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psmd1Q3TXS7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Psmd1Q3TXS7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psmd1Q3TXS7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Psmd1Q3TXS7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Psmd1Q3TXS7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Psmd1Q3TXS7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Psmd1Q3TXS7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Psmd1Q3TXS7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Psmd1Q3TXS7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Psmd1Q3TXS7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psmd1Q3TXS7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psmd1Q3TXS7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psmd1Q3TXS7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psmd1Q3TXS7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Psmd1Q3TXS7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Psmd1Q3TXS7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Psmd1Q3TXS7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Psmd1Q3TXS7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psmd1Q3TXS7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psmd1Q3TXS7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psmd1Q3TXS7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psmd1Q3TXS7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psmd1Q3TXS7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Psmd1Q3TXS7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psmd1Q3TXS7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psmd1Q3TXS7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psmd1Q3TXS7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psmd1Q3TXS7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Psmd1Q3TXS7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Psmd1Q3TXS7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psmd1Q3TXS7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psmd1Q3TXS7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psmd1Q3TXS7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psmd1Q3TXS7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psmd1Q3TXS7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Psmd1Q3TXS7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psmd1Q3TXS7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psmd1Q3TXS7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psmd1Q3TXS7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Psmd1Q3TXS7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psmd1Q3TXS7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Psmd1Q3TXS7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Psmd1Q3TXS7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms