Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccndbp1Q3TVC7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccndbp1Q3TVC7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccndbp1Q3TVC7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccndbp1Q3TVC7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccndbp1Q3TVC7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccndbp1Q3TVC7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccndbp1Q3TVC7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccndbp1Q3TVC7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccndbp1Q3TVC7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccndbp1Q3TVC7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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