Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pnpla6Q3TRM4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pnpla6Q3TRM4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pnpla6Q3TRM4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pnpla6Q3TRM4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pnpla6Q3TRM4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pnpla6Q3TRM4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pnpla6Q3TRM4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pnpla6Q3TRM4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pnpla6Q3TRM4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pnpla6Q3TRM4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pnpla6Q3TRM4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pnpla6Q3TRM4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pnpla6Q3TRM4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pnpla6Q3TRM4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pnpla6Q3TRM4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pnpla6Q3TRM4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pnpla6Q3TRM4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pnpla6Q3TRM4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Pnpla6Q3TRM4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pnpla6Q3TRM4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pnpla6Q3TRM4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pnpla6Q3TRM4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pnpla6Q3TRM4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pnpla6Q3TRM4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pnpla6Q3TRM4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pnpla6Q3TRM4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pnpla6Q3TRM4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pnpla6Q3TRM4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pnpla6Q3TRM4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pnpla6Q3TRM4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pnpla6Q3TRM4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pnpla6Q3TRM4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pnpla6Q3TRM4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pnpla6Q3TRM4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pnpla6Q3TRM4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pnpla6Q3TRM4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pnpla6Q3TRM4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pnpla6Q3TRM4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pnpla6Q3TRM4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pnpla6Q3TRM4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pnpla6Q3TRM4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pnpla6Q3TRM4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pnpla6Q3TRM4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pnpla6Q3TRM4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pnpla6Q3TRM4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pnpla6Q3TRM4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pnpla6Q3TRM4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pnpla6Q3TRM4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pnpla6Q3TRM4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pnpla6Q3TRM4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pnpla6Q3TRM4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pnpla6Q3TRM4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms