Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Calr4Q3TQS0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Calr4Q3TQS0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Calr4Q3TQS0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Calr4Q3TQS0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Calr4Q3TQS0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Calr4Q3TQS0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Calr4Q3TQS0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Calr4Q3TQS0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Calr4Q3TQS0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Calr4Q3TQS0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Calr4Q3TQS0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Calr4Q3TQS0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Calr4Q3TQS0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Calr4Q3TQS0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Calr4Q3TQS0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Calr4Q3TQS0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Calr4Q3TQS0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Calr4Q3TQS0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Calr4Q3TQS0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Calr4Q3TQS0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Calr4Q3TQS0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Calr4Q3TQS0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Calr4Q3TQS0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Calr4Q3TQS0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Calr4Q3TQS0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Calr4Q3TQS0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms