Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ctdnep1Q3TP92 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ctdnep1Q3TP92 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ctdnep1Q3TP92 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ctdnep1Q3TP92 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ctdnep1Q3TP92 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ctdnep1Q3TP92 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ctdnep1Q3TP92 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ctdnep1Q3TP92 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ctdnep1Q3TP92 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ctdnep1Q3TP92 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ctdnep1Q3TP92 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ctdnep1Q3TP92 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ctdnep1Q3TP92 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ctdnep1Q3TP92 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ctdnep1Q3TP92 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctdnep1Q3TP92 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctdnep1Q3TP92 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctdnep1Q3TP92 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctdnep1Q3TP92 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctdnep1Q3TP92 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctdnep1Q3TP92 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ctdnep1Q3TP92 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ctdnep1Q3TP92 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ctdnep1Q3TP92 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ctdnep1Q3TP92 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ctdnep1Q3TP92 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctdnep1Q3TP92 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctdnep1Q3TP92 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms