Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem248Q3TBN1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem248Q3TBN1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem248Q3TBN1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmem248Q3TBN1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem248Q3TBN1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmem248Q3TBN1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem248Q3TBN1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem248Q3TBN1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem248Q3TBN1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem248Q3TBN1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem248Q3TBN1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem248Q3TBN1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem248Q3TBN1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem248Q3TBN1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem248Q3TBN1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem248Q3TBN1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem248Q3TBN1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem248Q3TBN1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem248Q3TBN1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem248Q3TBN1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem248Q3TBN1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms