Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9M1

Mfsd2b, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd2bQ3T9M1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd2bQ3T9M1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd2bQ3T9M1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd2bQ3T9M1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd2bQ3T9M1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd2bQ3T9M1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms