Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtl9Q32KG4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Rtl9Q32KG4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rtl9Q32KG4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms