Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdgfl1Q2VPR5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdgfl1Q2VPR5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdgfl1Q2VPR5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdgfl1Q2VPR5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdgfl1Q2VPR5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdgfl1Q2VPR5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdgfl1Q2VPR5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdgfl1Q2VPR5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdgfl1Q2VPR5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdgfl1Q2VPR5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdgfl1Q2VPR5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdgfl1Q2VPR5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdgfl1Q2VPR5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdgfl1Q2VPR5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdgfl1Q2VPR5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdgfl1Q2VPR5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdgfl1Q2VPR5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdgfl1Q2VPR5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdgfl1Q2VPR5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdgfl1Q2VPR5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms