Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim71Q1PSW8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim71Q1PSW8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim71Q1PSW8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim71Q1PSW8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim71Q1PSW8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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