Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Tdrd9Q14BI7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Tdrd9Q14BI7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Tdrd9Q14BI7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Tdrd9Q14BI7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Tdrd9Q14BI7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Tdrd9Q14BI7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Tdrd9Q14BI7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Tdrd9Q14BI7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Tdrd9Q14BI7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Tdrd9Q14BI7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Tdrd9Q14BI7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Tdrd9Q14BI7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Tdrd9Q14BI7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Tdrd9Q14BI7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Tdrd9Q14BI7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Tdrd9Q14BI7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Tdrd9Q14BI7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Tdrd9Q14BI7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Tdrd9Q14BI7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Tdrd9Q14BI7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Tdrd9Q14BI7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Tdrd9Q14BI7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Tdrd9Q14BI7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Tdrd9Q14BI7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Tdrd9Q14BI7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Tdrd9Q14BI7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Tdrd9Q14BI7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Tdrd9Q14BI7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Tdrd9Q14BI7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Tdrd9Q14BI7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Tdrd9Q14BI7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Tdrd9Q14BI7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tdrd9Q14BI7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tdrd9Q14BI7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tdrd9Q14BI7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tdrd9Q14BI7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Tdrd9Q14BI7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Tdrd9Q14BI7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Tdrd9Q14BI7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Tdrd9Q14BI7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Tdrd9Q14BI7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Tdrd9Q14BI7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Tdrd9Q14BI7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Tdrd9Q14BI7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tdrd9Q14BI7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tdrd9Q14BI7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Tdrd9Q14BI7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Tdrd9Q14BI7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Tdrd9Q14BI7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Tdrd9Q14BI7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Tdrd9Q14BI7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Tdrd9Q14BI7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Tdrd9Q14BI7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Tdrd9Q14BI7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Tdrd9Q14BI7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Tdrd9Q14BI7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Tdrd9Q14BI7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Tdrd9Q14BI7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Tdrd9Q14BI7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Tdrd9Q14BI7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Tdrd9Q14BI7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Tdrd9Q14BI7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Tdrd9Q14BI7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Tdrd9Q14BI7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Tdrd9Q14BI7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Tdrd9Q14BI7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Tdrd9Q14BI7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Tdrd9Q14BI7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Tdrd9Q14BI7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Tdrd9Q14BI7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Tdrd9Q14BI7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Tdrd9Q14BI7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Tdrd9Q14BI7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Tdrd9Q14BI7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Tdrd9Q14BI7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Tdrd9Q14BI7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Tdrd9Q14BI7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Tdrd9Q14BI7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Tdrd9Q14BI7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Tdrd9Q14BI7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Tdrd9Q14BI7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Tdrd9Q14BI7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Tdrd9Q14BI7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Tdrd9Q14BI7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Tdrd9Q14BI7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Tdrd9Q14BI7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Tdrd9Q14BI7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Tdrd9Q14BI7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Tdrd9Q14BI7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Tdrd9Q14BI7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Tdrd9Q14BI7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Tdrd9Q14BI7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Tdrd9Q14BI7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Tdrd9Q14BI7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Tdrd9Q14BI7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Tdrd9Q14BI7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Tdrd9Q14BI7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Tdrd9Q14BI7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Tdrd9Q14BI7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
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