Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd12Q0VE29 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd12Q0VE29 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samd12Q0VE29 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms