Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cib3Q0P523 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cib3Q0P523 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cib3Q0P523 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms