Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ubxn2bQ0KL01 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubxn2bQ0KL01 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ubxn2bQ0KL01 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ubxn2bQ0KL01 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ubxn2bQ0KL01 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ubxn2bQ0KL01 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ubxn2bQ0KL01 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ubxn2bQ0KL01 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ubxn2bQ0KL01 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ubxn2bQ0KL01 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ubxn2bQ0KL01 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ubxn2bQ0KL01 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ubxn2bQ0KL01 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ubxn2bQ0KL01 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ubxn2bQ0KL01 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ubxn2bQ0KL01 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ubxn2bQ0KL01 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ubxn2bQ0KL01 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ubxn2bQ0KL01 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ubxn2bQ0KL01 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ubxn2bQ0KL01 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Ubxn2bQ0KL01 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ubxn2bQ0KL01 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ubxn2bQ0KL01 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ubxn2bQ0KL01 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ubxn2bQ0KL01 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ubxn2bQ0KL01 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ubxn2bQ0KL01 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ubxn2bQ0KL01 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubxn2bQ0KL01 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubxn2bQ0KL01 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubxn2bQ0KL01 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubxn2bQ0KL01 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ubxn2bQ0KL01 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ubxn2bQ0KL01 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ubxn2bQ0KL01 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ubxn2bQ0KL01 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubxn2bQ0KL01 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubxn2bQ0KL01 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms