Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cass4Q08EC4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cass4Q08EC4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cass4Q08EC4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms