Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NrepQ07475 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrepQ07475 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrepQ07475 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NrepQ07475 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NrepQ07475 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms