Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sox8Q04886 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox8Q04886 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox8Q04886 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Sox8Q04886 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox8Q04886 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox8Q04886 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox8Q04886 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sox8Q04886 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sox8Q04886 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sox8Q04886 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Sox8Q04886 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sox8Q04886 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox8Q04886 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox8Q04886 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox8Q04886 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox8Q04886 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox8Q04886 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms