Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RelbQ04863 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RelbQ04863 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RelbQ04863 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RelbQ04863 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RelbQ04863 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RelbQ04863 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RelbQ04863 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RelbQ04863 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RelbQ04863 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RelbQ04863 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RelbQ04863 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RelbQ04863 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RelbQ04863 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RelbQ04863 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RelbQ04863 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RelbQ04863 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RelbQ04863 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RelbQ04863 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RelbQ04863 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RelbQ04863 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RelbQ04863 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RelbQ04863 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RelbQ04863 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RelbQ04863 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RelbQ04863 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RelbQ04863 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RelbQ04863 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RelbQ04863 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RelbQ04863 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RelbQ04863 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RelbQ04863 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
RelbQ04863 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RelbQ04863 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RelbQ04863 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RelbQ04863 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RelbQ04863 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RelbQ04863 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RelbQ04863 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RelbQ04863 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RelbQ04863 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RelbQ04863 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RelbQ04863 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RelbQ04863 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RelbQ04863 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RelbQ04863 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RelbQ04863 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RelbQ04863 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms