Protein–RNA interactions for Protein: Q03401

Crisp1, Cysteine-rich secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp1Q03401 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crisp1Q03401 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Crisp1Q03401 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Crisp1Q03401 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Crisp1Q03401 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Crisp1Q03401 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Crisp1Q03401 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Crisp1Q03401 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms