Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HmmrQ00547 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HmmrQ00547 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HmmrQ00547 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HmmrQ00547 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HmmrQ00547 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HmmrQ00547 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HmmrQ00547 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HmmrQ00547 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HmmrQ00547 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HmmrQ00547 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HmmrQ00547 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HmmrQ00547 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HmmrQ00547 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HmmrQ00547 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HmmrQ00547 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HmmrQ00547 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HmmrQ00547 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HmmrQ00547 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HmmrQ00547 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HmmrQ00547 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms