Protein–RNA interactions for Protein: P97817

Cdr2, Cerebellar degeneration-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2P97817 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdr2P97817 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdr2P97817 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdr2P97817 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cdr2P97817 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdr2P97817 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdr2P97817 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms