Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cry1P97784 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cry1P97784 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cry1P97784 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cry1P97784 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cry1P97784 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cry1P97784 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cry1P97784 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cry1P97784 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cry1P97784 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cry1P97784 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cry1P97784 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cry1P97784 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cry1P97784 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cry1P97784 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cry1P97784 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cry1P97784 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cry1P97784 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cry1P97784 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cry1P97784 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cry1P97784 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cry1P97784 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cry1P97784 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cry1P97784 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cry1P97784 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cry1P97784 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cry1P97784 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cry1P97784 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cry1P97784 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cry1P97784 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cry1P97784 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cry1P97784 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cry1P97784 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cry1P97784 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cry1P97784 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cry1P97784 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cry1P97784 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cry1P97784 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cry1P97784 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cry1P97784 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cry1P97784 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cry1P97784 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cry1P97784 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms