Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr2cP97760 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Polr2cP97760 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2cP97760 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2cP97760 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms