Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad4P97471 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smad4P97471 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smad4P97471 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad4P97471 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad4P97471 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smad4P97471 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smad4P97471 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smad4P97471 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smad4P97471 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smad4P97471 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smad4P97471 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smad4P97471 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smad4P97471 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad4P97471 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad4P97471 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad4P97471 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad4P97471 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad4P97471 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad4P97471 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad4P97471 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad4P97471 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad4P97471 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smad4P97471 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smad4P97471 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smad4P97471 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smad4P97471 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smad4P97471 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smad4P97471 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smad4P97471 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smad4P97471 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smad4P97471 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Smad4P97471 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smad4P97471 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smad4P97471 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad4P97471 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad4P97471 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad4P97471 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad4P97471 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad4P97471 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad4P97471 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad4P97471 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad4P97471 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad4P97471 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad4P97471 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smad4P97471 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smad4P97471 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smad4P97471 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smad4P97471 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad4P97471 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms